Apikal rezeksiyon, başka bir ifadeyle apikoektomi, dişin kök ucunun ve enfekte olmuş çevresinin çıkarılması işlemidir. Patolojik durumun kök kanal tedavisiyle dahi iyileşmemesi, tekrarlaması veya rahatsızlığın boyutlarının kök kanal tedavisine izin vermediği durumlarda uygulanan bu yöntem, kök ucundaki kemik destüksiyonun kaldırılıp o bölgenin suturlanarak kapatılması şeklinde uygulanır. Bir ile bir buçuk saat arasında değişen bir operasyon olan apikal rezeksiyon sonrasında yeni kemik dokusunun oluşmasıyla hasta ağız sağlığına yeniden kavuşmuş olur.